目前對于本科，碩士，博士畢業論文，高校都是要求進行論文查重的，碩博論文是100%全部查重，同時畢業后一兩年后還會進行抽檢復查。

對于本科或專科論文，一般重點院校都是全部查重的，一些非重點院校可能會對部分論文進行抽檢，甚至有一部分成人本科，專升本學歷的只要求提交一個合格的查重報告，學校不去進行查重的。

本科論文查重看用什么系統了，如果是學術，就把整篇提交到系統，系統會排除目錄、參考文獻等，其他的如正文、代碼、附錄、致謝都要查，不知道你們學校如何規定的。其他論文查重系統一般都是查正文，把文章復制進系統就可以。

理論情況下，論文的整個篇幅都是需要查重的，所以引言也需要檢查重復率。

論文里最可能重復的就是第一章的緒論或者引言，因為要大量引用別人的文章，要是這都不重復，甚至會被懷疑文章的可信度。

我的經驗是，把重要的文章通讀，然后把中心思想重新總結下，這樣不至于完全重復，查重是有自己的規則的，只要別無腦復制粘貼，不會重復的太多的。