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首先這兩者的數據庫和查重算法肯定是不相同的，這就造成同一篇論文在這兩個檢測系統里的檢測結果肯定不同。但是paperpass也不一定一直比學術查重高，但是他的費用低這倒是真的，另外paperyy收費也低，并且還有免費版的。
一、PaperPass網絡資源庫比學術的網絡資源庫更大
PaperPass由超過9000萬的學術期刊和學位論文以及一個超過10億數量的互聯網網頁數據庫組成；而學術檢測范圍中有互聯網文檔資源和互聯網資源(包含貼吧等論壇資源)。顯然網絡資源PaperPass更有優勢，因此PaperPass比學術嚴。
二、PaperPass沒有學術那么先進科學的識別
在格式正確的前提下，學術可以識別到目錄和參考文獻實現自動剔除不參與正文檢測，同時還可以根據目錄來分章節查重，可以根據參考文獻來檢測引用率；而PaperPass就顯得笨拙許多，PaperPass不能科學的識別出目錄和參考文獻并會把他們當做正文來檢測，顯然目錄和參考文獻都是非常比較容易重復的，因此PaperPass查重結果比學術嚴。關于目錄和參考文獻如何正確寫，在“學術不端網”搜索文章關鍵詞即可更詳盡的說明。
三、計算重復率的規則原理不同
PaperPass是紅色重度抄襲，黃色輕度抄襲，只有綠色是安全的 ；而學術紅色抄襲，黃色引用，重復率是重復字數和總字數的比值。顯然PaperPass計算的虛高，因此PaperPass更嚴格。
總的來說PaperPass檢測嚴格的原因主要就是不太科學，還有就是有點虛高了，不管三七二十一的自己寫的也很容易被標紅算重復。不要把PaperPass看成一顆救命稻草，畢竟高校一般都是以學術為準，最后還是要到“學術不端網”進行一次學術檢測比較保險。也有個別本科院校采用PaperPass為準，但是這種情況很少的，在我們查重之前一定要弄清楚我們學校用哪個查重系統，以哪個查重系統為準！
用的可能不是一個查重系統，所以得出來的結果不一樣。
