這是很多人疑惑的一個地方，畢竟參考文獻太容易重復了。 答案是： 學術查重對象不包括參考文獻，但你也不需要將參考文獻從論文中刪除。 以學術查重來說，可以肯定的是：查重對象是不包括參考文獻的。 而且，就算你沒有將參考文獻從論文中刪除，學術也是能正常識別出來參考文獻部分的，前提是你的論文結構是規范的，而且按照 規范格式 引用了參考文獻。 簡單來說，按照學校要求的大綱架構和參考文獻引用規范（GB/T-7714）去寫論文，學術都能識別出參考文獻部分，并在查重時自動剔除。 不僅是參考文獻部分，諸如論文封面、目錄、成果清單等內容也是不在查重范圍內的。 而且，在查重報告中， 不納入查重范圍的參考文獻、目錄等內容都會以灰色字體顯示，而正文則以黑色字體顯示。
學術論文查重系統計算的總字數，是Word文檔里統計的字符總數(計空格)，而不是單純的依據Word里所統計的字數。 所以說，不合理的排版（空格）格式，對于各位專家學者們進行學術論文查重是有著不小的阻礙作用的。 學術查重時表格里面的內容也會算字數，而簡單的Word統計的時候一般表格統計不到字數。 這也就是說，學術論文查重入口可以有效的辨別表格是否是重復的的問題。 每篇文章基本都會有英文摘要或者英文參考文獻，對于英文更占字符數了。
對于 學術查重系統 來說，總文字復制比就是總結果，是包括抄襲和引用的。 不管怎么引用，引用的格式是否正確，都會算重復率，引用正確只是可以看出“去除引用文獻文字復制比”，如果學校看這個結果也可以，但是一樣不能過度引用： http://www.
但是像我所在的浙江大學，學校為學生購買了學術查重服務，并集成到研究生管理系統了，而且， 用于查重的論文版本也是最終送審的版本 。 這意味著，刪除參考文獻是不可取的，因為送審版本是需要包括參考文獻的。
