包括的。
AMLC采用CNKI自主研發的自適應多階指紋（AMLFP）特征檢測技術，具有檢測速度快，準確率，召回率較高，抗干擾性強等特征。支持篇章、段落、句子各層級檢測；支持文獻改寫，多篇文獻組合等各種文獻變形檢測；支持研究生論文、圖書專著等超長文獻的學術不端檢測。
對任意一篇需要檢測的文獻，系統首先對其進行分層處理，按照篇章、段落、句子等層級分別創建指紋，而比對資源庫中的比對文獻，也采取同樣技術創建指紋索引。
學術不端文獻檢測的相關要求規定：
1、管理人員可以選擇將檢測文獻放入個人比對庫或者批量上傳文獻作為個人比對庫，該個人比對庫即可作為以后學術不端文獻檢測的比對數據庫，該自建個人比對庫完全屬于用戶。
2、檢測系統能夠自動將屬于用戶的已正式發表的論文檢索出來，并對每一篇已發表文獻進行實時檢測，快速給出檢測結果。
3、用戶可以將檢測結果中確認有問題的文獻放入到問題庫，便于用戶集中管理。
首先可以明確清楚的是，碩士論文的正文是必查部分，除此之外，碩士論文內容的查重范圍還包括有論文封面、聲明、摘要、致謝、參考文獻和論文附錄等，如果將論文的開題報告也上傳了的話，也是會進行重復率檢測的。
對于碩士論文來說，檢測碩士論文重復率最準確的論文查重系統是學術VIP論文查重系統，學術的數據庫比對查重范圍由以下數據庫構成：中國學術期刊網絡出版總庫、中國博士學位論文全文數據庫/中國優秀碩士學位論文全文數據庫、中國重要會議論文全文數據庫、中國重要報紙全文數據庫、中國專利全文數據庫、學術論文聯合比對庫、互聯網資源、英文數據庫、港澳臺學術文獻庫、優先出版文獻庫、圖書資源、個人比對庫和學術論文聯合比對庫等。
做標記的地方應該就不算了吧。
